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肠道菌群XX

肠道菌群XX

1、摘要：人类微生物组细胞数量是人体细胞的十倍， 其中以肠道微生物最为丰富。基于高通量测序等技术的发展开启了人类肠道宏基因组及其与人类宿主关系的研究。研究显示， 肠道微生物与机体的系统发育以及糖尿病、肥胖症等疾病密切相关， 未来肠道微生物的相关信息有望成为诊断和治疗依据。

2、人类肠道微生物数量庞大、种类繁多， 被称为“第二基因组”, 与机体健康有着极为密切的联系。近年来， 肠道菌群研究已成为生物学领域的研究热点之一。微生物组研究技术的迅猛发展， 使得进一步了解肠道微生物与人类机体的系统发育以及健康的关系成为可能。

3、肠道菌群的研究主要集中于对肠道中微生物多样性 （包括数量、种类和组成） 的认识。早期主要采用微生物鉴定和分类的方法， 在此基础上进一步了解其功能活性， 研究方法如革兰氏染色法、糖发酵试验、IMVi C试验等：是通过微生物的分解糖类的能力、是否产酸、产气等理化性质进行物种的鉴定与分类。肠道微生物的研究也正是基于这些技术手段而逐步发展起来的。

4、微生物普查大约始于25年前。最初使用的方法是16S rRNA基因测序[1], 先利用PCR技术XX16S rRNA基因， 再通过两到三次Sanger法测序 （一代测序） 完成整个基因的测序。对不同个体进行比较时， 只需确定序列的光谱是否相似并判断差异程度。但Sanger法测序的读取长度仅为几百个碱基， 每次只能获得部分取样基因的序列， 灵敏度低， 且成本昂贵， XX了取样深度， 对低丰度微生物的分析十分有限。目前已开发出了下一代测序技术， 又称二代测序技术或高通量测序技术， 一次可对几十万到几百万条核酸分子进行序列测定。这种方法快速、经济、通量高， 每个样品可产生高达数百万的读数， 但缺点是读取长度通常非常短[2].随后又发展出了三代测序技术， 这是单分子测序技术， 测序时无需经过PCR扩增， 实现了对每一条DNA分子的单独测序。二代测序和三代测序技术对宏基因组学研究在广度上和深度上都产生了巨大的影响， 带来了研究方法的变革。